Cycles biogéochimiques : suivre l'eau, le carbone et l'azote

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Cycles biogéochimiques : suivre une molécule d'eau, un atome de carbone et un atome d'azote

Sur Terre, la matière ne se perd pas : l'eau, le carbone et l'azote passent sans cesse d'un réservoir à l'autre (air, eau, roches, êtres vivants), poussés par des phénomènes physiques et par l'activité des êtres vivants, et l'homme accélère ou détourne certains de ces passages.

Objectifs

  • Décrire un cycle avec le vocabulaire des réservoirs et des flux, et calculer un temps de séjour.
  • Distinguer les transferts abiotiques (physiques, chimiques) et biologiques dans les cycles de l'eau, du carbone et de l'azote.
  • Suivre le trajet d'un atome à travers plusieurs réservoirs.
  • Expliquer le rôle des organismes (plantes, décomposeurs, bactéries du sol) et des activités humaines.

1. Réservoirs, flux et temps de séjour

Un cycle biogéochimique est le trajet qu'un élément chimique (ou l'eau) fait en boucle entre le vivant (bio) et le non-vivant (géo : air, eau, sol, roches).

  • Un réservoir est un compartiment où l'élément est stocké : atmosphère, océans et eaux douces, sols et roches, êtres vivants (biomasse).
  • Un flux est la quantité qui passe d'un réservoir à un autre pendant une durée donnée (par jour, par an).
  • Les transferts sont abiotiques quand ils ne dépendent pas des êtres vivants (évaporation, pluie, dissolution dans l'eau, volcanisme, sédimentation) et biologiques quand des êtres vivants les réalisent (photosynthèse, respiration, transpiration des plantes, décomposition, fixation de l'azote).

Quand un réservoir reçoit autant qu'il perd, sa quantité reste stable. On définit alors le temps de séjour moyen de l'élément dans ce réservoir :

\[ \text{temps de séjour} = \frac{\text{quantité stockée dans le réservoir}}{\text{flux d'entrée (égal au flux de sortie)}} \]

Exemple résolu 1 : la mare du village

Une mare contient 60 000 m³ d'eau. Pendant la saison des pluies, elle reçoit 1 500 m³ par jour (pluie et ruissellement) et en perd autant (évaporation, infiltration, abreuvement du bétail). Combien de temps, en moyenne, une goutte d'eau reste-t-elle dans la mare ? (valeurs d'exercice)

Voir la solution
La quantité reste stable car entrées = sorties = 1 500 m³/jour : on peut utiliser la formule.
\(\text{temps de séjour} = \dfrac{60\,000\ \text{m}^3}{1\,500\ \text{m}^3/\text{jour}} = 40\ \text{jours}\).
Interprétation : l'eau de la mare est entièrement renouvelée en un peu plus d'un mois en moyenne. Une pollution y serait diluée et évacuée plus vite que dans une nappe profonde, où l'eau peut séjourner très longtemps.

Lequel de ces transferts est biologique ?

  1. L'évaporation de l'eau de mer
  2. La respiration d'un termite
  3. La dissolution du dioxyde de carbone dans la mer
La respiration est réalisée par un être vivant. L'évaporation et la dissolution sont des phénomènes physico-chimiques qui se produisent même sans vie.

2. Le voyage d'une molécule d'eau

Le cycle de l'eau est mis en mouvement par l'énergie du Soleil (qui évapore l'eau) et par la gravité (qui la fait tomber et s'écouler).

  1. Évaporation à la surface de l'océan, des lacs et des sols (abiotique), et transpiration des plantes par leurs feuilles (biologique) : ensemble, on parle d'évapotranspiration.
  2. Condensation en nuages en altitude, transport par les vents.
  3. Précipitations (pluie).
  4. Au sol : ruissellement vers les rivières puis la mer, ou infiltration vers les nappes phréatiques ; une partie est absorbée par les racines.

Légende toi-même le schéma : touche chaque point et donne le nom du réservoir ou du phénomène.

Schéma du cycle de l'eau entre l'océan, les nuages, la pluie, la végétation et la nappe phréatique

Les pointillés montent depuis l'océan (évaporation) et depuis l'arbre (transpiration) ; la flèche qui descend dans le sol représente l'infiltration ; celle qui longe la pente vers la mer, le ruissellement.

Après une forte pluie sur un champ dénudé, quel trajet de l'eau augmente le plus ?

  1. La transpiration
  2. L'infiltration vers la nappe
  3. Le ruissellement
Sans végétation pour retenir l'eau et aérer le sol, l'eau s'écoule en surface au lieu de pénétrer : le ruissellement augmente, et avec lui l'érosion.

3. Le voyage d'un atome de carbone

Le carbone se trouve dans l'atmosphère (\(\ce{CO2}\)), dans les océans (\(\ce{CO2}\) dissous, ions hydrogénocarbonate), dans les êtres vivants (matière organique), dans les sols (humus) et dans les roches (calcaire, charbon, pétrole, gaz naturel).

flowchart LR
  A[CO2 de l air] -->|photosynthese| B[Plantes]
  B -->|consommation| C[Animaux]
  B -->|respiration| A
  C -->|respiration| A
  B -->|feuilles mortes| D[Sol et decomposeurs]
  C -->|cadavres| D
  D -->|respiration| A
  A <-->|dissolution| E[Ocean]
  E -->|coquilles| F[Calcaire]
  G[Charbon petrole gaz] -->|combustion| A

Les principaux transferts biologiques s'écrivent avec deux équations inverses :

\[ \text{photosynthèse : } \ce{6CO2 + 6H2O -> C6H12O6 + 6O2} \] \[ \text{respiration : } \ce{C6H12O6 + 6O2 -> 6CO2 + 6H2O} \]

Dans la mer, des organismes fabriquent leur coquille en calcaire : \(\ce{Ca^2+ + 2HCO3- -> CaCO3 + CO2 + H2O}\). Accumulées au fond pendant des millions d'années, ces coquilles forment des roches calcaires : le carbone y est stocké pour très longtemps. Les combustibles fossiles sont aussi d'anciens restes d'êtres vivants transformés dans le sous-sol.

Exemple résolu 2 : suivre un atome de carbone

Un atome de carbone est dans l'air de Kara. Il entre dans une feuille de néré, la feuille est mangée par une chèvre, la chèvre le rejette en respirant. Nomme chaque transfert et dis s'il est biologique ou abiotique.

Voir la solution
Air vers feuille : photosynthèse ; le carbone du \(\ce{CO2}\) entre dans un sucre. Transfert biologique.
Feuille vers chèvre : consommation (alimentation) ; le carbone passe dans la matière organique de la chèvre. Transfert biologique.
Chèvre vers air : respiration ; le sucre est oxydé et le carbone repart en \(\ce{CO2}\). Transfert biologique.
Suite possible : ce \(\ce{CO2}\) se dissout dans l'océan (transfert abiotique) ou est repris par une autre plante. La boucle est fermée.

Quel transfert fait sortir du carbone de l'atmosphère ?

  1. La photosynthèse
  2. La respiration des décomposeurs
  3. Un feu de brousse
La photosynthèse prélève le \(\ce{CO2}\) de l'air pour fabriquer de la matière organique. Respiration et combustion font l'inverse : elles rejettent du \(\ce{CO2}\).

4. Le voyage d'un atome d'azote

L'air est composé en majorité de diazote \(\ce{N2}\), mais ni les plantes ni les animaux ne peuvent l'utiliser directement. Les plantes absorbent l'azote du sol, surtout sous forme d'ions nitrate \(\ce{NO3-}\). Ce sont des bactéries qui font la plupart des transformations :

  1. Fixation : des bactéries, dont les Rhizobium logées dans les nodosités des racines des légumineuses (arachide, niébé, soja), transforment \(\ce{N2}\) en azote utilisable \(\ce{NH4+}\). Les éclairs en fixent aussi un peu (transfert abiotique).
  2. Absorption et consommation : la plante fabrique ses protéines ; l'animal qui la mange récupère cet azote.
  3. Ammonification : les décomposeurs transforment l'azote des cadavres, feuilles et excréments en ions ammonium \(\ce{NH4+}\).
  4. Nitrification : d'autres bactéries du sol oxydent l'ammonium en nitrite puis en nitrate, \(\ce{NH4+ -> NO2- -> NO3-}\).
  5. Dénitrification : dans les sols gorgés d'eau, privés d'oxygène, certaines bactéries renvoient l'azote dans l'air, \(\ce{NO3- -> N2}\).
flowchart LR
  A[N2 de l air] -->|fixation| B[Ammonium du sol]
  B -->|nitrification| C[Nitrate du sol]
  C -->|absorption| D[Plantes]
  D -->|consommation| E[Animaux]
  D -->|restes| F[Decomposeurs]
  E -->|restes| F
  F -->|ammonification| B
  C -->|denitrification| A

Exemple résolu 3 : pourquoi le mil pousse mieux après l'arachide

Explique, à l'aide du cycle de l'azote, l'avantage de cultiver du mil sur une parcelle où l'on a récolté de l'arachide l'année précédente.

Voir la solution
Les nodosités des racines d'arachide contiennent des bactéries Rhizobium qui fixent le \(\ce{N2}\) de l'air : la plante dispose d'azote même dans un sol pauvre.
Après la récolte, les racines, nodosités et feuilles restées dans le champ sont décomposées : leur azote devient de l'ammonium (ammonification), puis du nitrate (nitrification).
L'année suivante, le mil absorbe ces nitrates par ses racines : le sol a été enrichi en azote sans engrais chimique.

Sous quelle forme une plante de maïs absorbe-t-elle surtout l'azote ?

  1. Le diazote de l'air, par ses feuilles
  2. Les ions nitrate du sol, par ses racines
  3. Les protéines des feuilles mortes, directement
Le diazote n'est pas utilisable par la plante, et les protéines des restes doivent d'abord être transformées par les décomposeurs puis par les bactéries nitrifiantes : la plante absorbe le nitrate obtenu.

5. L'homme dans les cycles

ActivitéCycle touchéEffet
Brûler du pétrole, du gaz, du charbonCarboneRenvoie très vite dans l'air du carbone stocké depuis longtemps : le \(\ce{CO2}\) de l'atmosphère augmente et renforce l'effet de serre.
Déforestation, feux de brousse répétésCarbone, eauLibère le carbone de la biomasse, réduit la photosynthèse et la transpiration, augmente ruissellement et érosion.
Engrais azotés en excèsAzoteNitrates entraînés vers les eaux : eutrophisation des lacs et lagunes, nappes polluées.
Pompage intensif, barragesEauModifient le trajet et le temps de séjour de l'eau : nappes qui baissent, débits des fleuves changés.
Rotation avec légumineuses, reboisement, compostAzote, carboneEffet favorable : enrichit les sols en azote et en matière organique, stocke du carbone.

Quelle pratique ramène de la matière organique dans le sol et entretient le cycle de l'azote ?

  1. Brûler les résidus de récolte
  2. Laisser le champ nu toute la saison sèche
  3. Faire du compost avec les déchets végétaux
Dans le compost, les décomposeurs transforment les restes végétaux ; leur carbone et leur azote reviennent au sol au lieu de partir en fumée.

Erreurs fréquentes

  • Confondre cycle et flux : la matière (eau, carbone, azote) suit un cycle ; l'énergie, elle, traverse l'écosystème et se perd en chaleur.
  • Croire que les plantes respirent seulement la nuit : elles respirent jour et nuit ; le jour, la photosynthèse est simplement plus forte que la respiration.
  • Penser que les plantes prennent l'azote de l'air : seules certaines bactéries savent fixer \(\ce{N2}\).
  • Utiliser la formule du temps de séjour quand le réservoir n'est pas stable : elle suppose entrées = sorties.

Récapitulatif

  • Un cycle relie des réservoirs (air, eaux, sols et roches, êtres vivants) par des flux ; temps de séjour = stock ÷ flux.
  • Eau : évaporation et transpiration, condensation, précipitations, ruissellement et infiltration ; moteur : Soleil et gravité.
  • Carbone : photosynthèse et respiration en sens inverses ; stockage long dans les roches et les combustibles fossiles.
  • Azote : fixation, ammonification, nitrification, dénitrification, presque toutes réalisées par des bactéries.
  • L'homme accélère certains flux (combustion, engrais, déforestation) mais peut aussi les rééquilibrer (légumineuses, reboisement, compost).
Réservoir
Compartiment où un élément est stocké : atmosphère, océans, sols et roches, êtres vivants.
Temps de séjour
Quantité stockée divisée par le flux d'entrée, quand le réservoir est stable.
Évapotranspiration
Évaporation des surfaces plus transpiration des plantes.
Fixation de l'azote
Transformation du diazote de l'air en ammonium par des bactéries, comme les Rhizobium des légumineuses.
Nitrification
Oxydation de l'ammonium en nitrite puis en nitrate par des bactéries du sol.
Eutrophisation
Excès de nitrates et phosphates dans l'eau : algues en masse, manque d'oxygène, poissons qui meurent.

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