Organites essentiels : suivre une protéine à travers la cellule
Organites essentiels : suivre une protéine à travers la cellule
La cellule eucaryote est divisée en compartiments, les organites, qui travaillent à la chaîne : le noyau donne les instructions, les ribosomes et le réticulum fabriquent, le Golgi finit et expédie, les mitochondries et les chloroplastes fournissent l'énergie.
Au lieu de présenter les organites un par un comme une liste, ce cours part d'une expérience historique : on suit, minute après minute, le trajet d'une protéine fabriquée et exportée par une cellule. Chaque organite rencontré est ensuite décrit avec sa « carte d'identité » et la façon de le reconnaître sur une photo de microscope électronique.
Objectifs
- Décrire la structure et le rôle du noyau, des ribosomes, du réticulum endoplasmique, de l'appareil de Golgi, de la mitochondrie et du chloroplaste.
- Reconnaître ces organites sur une électronographie à partir de critères précis.
- Exploiter des résultats expérimentaux pour retrouver le trajet d'une protéine sécrétée.
- Expliquer la notion de compartimentation et son intérêt pour la cellule.
- Relier l'abondance d'un organite à la fonction d'une cellule.
Partie 1 : l'enquête, le trajet d'une protéine exportée
Dans les années 1960, le biologiste George Palade et ses collègues ont voulu savoir quel chemin suit une protéine sécrétée dans la cellule. Ce travail fait partie de ceux qui lui ont valu le prix Nobel de médecine en 1974.
Le principe de l'expérience
Les résultats (valeurs arrondies et simplifiées)
| Temps après le marquage | Réticulum endoplasmique rugueux | Appareil de Golgi | Vésicules de sécrétion |
|---|---|---|---|
| 3 min | 80 % | 10 % | 10 % |
| 20 min | 20 % | 60 % | 20 % |
| 2 h | 5 % | 15 % | 80 % |
Exemple résolu 1 : exploiter le tableau
Dans quel ordre la protéine traverse-t-elle les compartiments ? Cherche d'abord.
Voir la solution
On repère, pour chaque temps, le compartiment le plus marqué :
- à 3 min, le marquage est surtout dans le réticulum endoplasmique rugueux (80 %) : c'est là que la protéine est fabriquée ;
- à 20 min, il est surtout dans l'appareil de Golgi (60 %) ;
- à 2 h, il est surtout dans les vésicules de sécrétion (80 %), prêtes à fusionner avec la membrane.
Le marquage se déplace d'un compartiment à l'autre : la protéine suit le trajet réticulum rugueux → Golgi → vésicules → extérieur de la cellule.
flowchart LR A[Noyau ADN] -->|ARN messager| B[Ribosomes du réticulum rugueux] B --> C[Réticulum rugueux] C -->|vésicule| D[Appareil de Golgi] D -->|vésicule de sécrétion| E[Membrane plasmique] E --> F[Extérieur de la cellule] G[Mitochondries] -.->|énergie ATP| C
À 20 minutes, où se trouve principalement la protéine marquée ?
Partie 2 : les cartes d'identité des organites
Le noyau : le centre des informations
Il contient l'ADN, qui porte l'information génétique. Il est entouré d'une enveloppe nucléaire formée de deux membranes, percée de pores nucléaires par lesquels sortent notamment les ARN messagers, copies des instructions. On y voit souvent un nucléole, zone sombre où se préparent les constituants des ribosomes. Taille : quelques micromètres, c'est en général le plus gros organite d'une cellule animale.
Les ribosomes : les machines à assembler les protéines
Ce sont de très petits grains, sans membrane, qui lisent l'ARN messager et assemblent les acides aminés en protéines. Ils sont libres dans le cytoplasme (protéines qui restent dans la cellule) ou fixés sur le réticulum (protéines destinées aux membranes ou à l'exportation).
Le réticulum endoplasmique
Réseau de sacs et de tubes aplatis, limité par une membrane, en continuité avec l'enveloppe du noyau.
- Rugueux (REG) : couvert de ribosomes, il fabrique les protéines à exporter ou à placer dans les membranes, qui entrent dans sa cavité.
- Lisse (REL) : sans ribosomes, il fabrique des lipides et participe, dans le foie, à la neutralisation de certaines substances toxiques.
L'appareil de Golgi : finition et expédition
Empilement de saccules aplatis et un peu courbés, entourés de nombreuses petites vésicules. Il reçoit les protéines du réticulum, les modifie (par exemple en leur ajoutant des sucres), les trie et les emballe dans des vésicules vers leur destination.
La mitochondrie : la centrale énergétique
Organite de un à quelques micromètres, limité par deux membranes : la membrane interne forme des replis, les crêtes, qui augmentent sa surface. C'est le lieu de la respiration cellulaire, qui utilise le dioxygène pour produire l'ATP, la « monnaie énergétique » de la cellule. Elle possède son propre petit ADN.
\[\ce{C6H12O6 + 6O2 -> 6CO2 + 6H2O} \quad + \text{énergie (ATP)}\]Le chloroplaste : le capteur de lumière (cellules végétales)
Présent chez les végétaux chlorophylliens et les algues, limité par deux membranes, il contient des sacs aplatis empilés, les thylakoïdes, qui portent la chlorophylle. C'est le lieu de la photosynthèse : il utilise l'énergie lumineuse pour fabriquer de la matière organique à partir de \(\ce{CO2}\) et d'eau. Il possède lui aussi son propre ADN.
\[\ce{6CO2 + 6H2O ->[lumière] C6H12O6 + 6O2}\]Schéma à légender
Place le nom de chaque organite sur ce schéma simplifié d'une cellule animale sécrétrice.
Sur une électronographie, un organite a deux membranes, dont l'interne forme des replis. C'est :
Partie 3 : la compartimentation
La compartimentation est la division de la cellule eucaryote en compartiments séparés par des membranes. Chaque compartiment a son propre contenu (enzymes, concentration en ions, acidité…) adapté à sa fonction.
- Des réactions incompatibles peuvent avoir lieu en même temps dans des compartiments différents.
- Les substances utiles sont concentrées au bon endroit : les réactions sont plus efficaces.
- La surface des membranes internes (crêtes, thylakoïdes, réticulum) offre beaucoup de place aux enzymes fixées.
- Les échanges entre compartiments sont contrôlés : pores du noyau, vésicules qui bourgeonnent et fusionnent.
Exemple résolu 2 : relier les organites à la fonction
Trois cellules sont observées au microscope électronique : A contient énormément de réticulum rugueux et un Golgi très développé ; B contient de très nombreuses mitochondries ; C contient de nombreux chloroplastes. Associe chaque cellule à : cellule de muscle, cellule de feuille de manioc, cellule de pancréas.
Quel est l'intérêt principal de la compartimentation ?
Erreurs fréquentes
- « Les cellules animales ont des chloroplastes » : non, seules les cellules chlorophylliennes (végétaux, algues) en ont ; les cellules végétales ont, elles, aussi des mitochondries.
- « Le ribosome est un organite à membrane » : non, il n'a pas de membrane, et il existe aussi chez les bactéries.
- « Les protéines sont fabriquées dans le Golgi » : non, elles sont fabriquées par les ribosomes ; le Golgi les modifie, les trie et les expédie.
- « La mitochondrie fabrique l'énergie à partir de rien » : elle convertit l'énergie chimique des nutriments (comme le glucose) en ATP, en utilisant le dioxygène.
Récapitulatif
- Une protéine sécrétée suit le trajet : ribosomes du réticulum rugueux → Golgi → vésicules de sécrétion → extérieur.
- Noyau (2 membranes, ADN, pores), ribosomes (sans membrane, synthèse des protéines), réticulum (rugueux : protéines ; lisse : lipides), Golgi (modification, tri, expédition).
- Mitochondrie (2 membranes, crêtes) : respiration et ATP. Chloroplaste (2 membranes, thylakoïdes) : photosynthèse.
- La compartimentation sépare les fonctions par des membranes et rend la cellule eucaryote plus efficace.
Sources : Fondation Nobel, prix Nobel de physiologie ou médecine 1974 (Claude, de Duve, Palade) ; Alberts et al., « Biologie moléculaire de la cellule ».
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